De molen heeft een verleden in het Molenpark op de Biest. Vroeger noemde hij De Hoogmolen en dateert uit de 17de eeuw.
Deze houten staakmolen stond oorspronkelijk op de hoek van de Hoogmolenstraat en de Vlasbloemstraat waar nu oud-gemeenteraadslid Xavier Wyckhuyse woont. Op 14 april 1944 werd de molen erkend als beschermd monument. Daarom was Xavier verplicht om de grondvesten in originele staat te behouden. De stukken van de molenstenen die waren blijven liggen in zijn tuin heeft hij geschonken aan de historische boerderij Goed te Nieuwenhove in de Platanendreef.
In de loop van de tijd werd hij regelmatig vernieuwd, onder meer na ernstige schade door oorlogsgeweld.
De Hoogmolen was eigendom van de zussen Martha, Leontine en Magdalena Van den Broucke die in de Geitebaardstraat woonden. Nu is dit de Stijn Streuvelsstraat 46 waar de renners Stockman nu wonen. Alphonse Vervaecke, grootvader van schilder John, was de laatste molenaar van de Hoogmolen. In 1968 kocht de stad Waregem de molen aan en verkocht hem in 1971 tenslotte door aan molenliefhebber Paul Bauters. In de periode van 1972 tot 1975 verhuisde de constructie uiteindelijk naar de Kruisemse deelgemeente Huise waar hij in 1975 weer maalvaardig werd gerestaureerd door Walter Mariman uit Zele. Intussen is de molen thans eigendom van de vzw Vlaamse Molens. In 2001 werd de meelproductie stilgelegd wegens te veel torsie maar was sinds 2012 opnieuw maalvaardig.
Op 19 juni 2026 werd de molen bij een zwaar onweer door een valwind verwoest. Na het noodweer werden de beschadigde delen door een molenbouwer en vrijwilligers van de vzw Vlaamse Molens gedemonteerd, genummerd en ingelijst. Ze liggen nu opgeslagen in een loods.
De schade wordt op 800.000 euro geraamd en daarvoor is een steunfonds opgericht waar elke bijdrage het verschil kan maken, je kan de gegevens terug vinden onder Vlaamse Molens. Het is de bedoeling om het monument terug op te bouwen in zijn originele staat.
Na een fietstochtje naar de restanten van de molen hebben Vlasbloemers alvast een duit in het zakje gedaan.
